寻找生物标记物的研究是蛋白质组学中的一个巨大领域。 LC-MS / MS一直被认为是蛋白质生物标志物检测和鉴定的首选方法。 不幸的是,基于质谱的蛋白质组学研究经常会受到体液组分复杂性的阻碍。 目前,尿液已成为替代血浆的生物标志物的一个潜在来源。 然而,对尿液的分级分析被认为是必要的,因为正常人尿中的蛋白质的数量和动态范围已经超出了当前MS技术的能力。11月2日,来自挪威奥斯陆大学的研究人员在Scientifc Reports上发表了题为“Isolation and mass spectrometry analysis of urinary extraexosomal proteins”的文章,他们通过分析尿液外泌体解决了尿液蛋白质质谱中的一些难点。
该研究的目的是开发基于LC-MS / MS的蛋白质组学分析方法分析尿液外泌体蛋白,从而发现有潜力的疾病生物标志物。简而言之,研究人员对来自健康受试者的尿液外泌体通过用磁珠免疫捕获分离,并用免疫荧光和TEM检测,在进行LC-MS分析酶解之前,不需要添加去污剂的情况下直接在磁珠上加速胰蛋白酶消化。据研究人员称,这是第一次对外泌体的外表面上的蛋白进行蛋白质组学分析。外泌体外表面的蛋白质组可以包含与可溶性货物蛋白相比具有更高生物标志物价值的蛋白质,因为突出到细胞外环境中的蛋白质可以更直接地参与外泌体的生理功能。通过蛋白质组分析,研究人员鉴定出了49个被认为是重要的蛋白质:大多数蛋白质参与了碳水化合物和脂质代谢或者免疫应答。其中的三十个蛋白质与疾病相关。开发利用尿液外泌体的蛋白质组学方法,可能在寻找疾病标志物,特别是代谢和免疫相关疾病的诊断或预后生物标志物方面具有很大的价值。
尿液外泌体的免疫分离及免疫检测过程(下图):
质谱分析得到的尿液外泌体蛋白(下表):
参考文献:Hildonen S, Skarpen E, Halvorsen TG, Reubsaet L. Isolation and mass spectrometry analysis of urinary extraexosomal proteins. Sci Rep. 2016 Nov 2;6:36331. PubMed PMID: 27805059.
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外泌体资讯网 Nature子刊:尿液外泌体蛋白的分离及质谱分析