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【2017-48期】This Week in Extracellular Vesicles

 

这是在2017年hzangs的最后一期周总结,希望大家在2017年有所收获。在这里也预祝大家“新年快乐”!本周hzangs在最新文献中选取了9篇分享给大家,其中7篇提供中文摘要。这次把一篇分数不是很高的文章放在了这些总结的最开始,hzangs很看重第1篇报道的意义,他们发现了进入外泌体的RNA所共有的一类基序,这对我们了解和认识外泌体对RNA的筛选具有积极作用,相信介导RNA进入外泌体肯定不是单一的基序,可能有很多种吧;第2篇介绍的是一种生物工程设计的囊泡样药载,并介绍了其优点;第3篇介绍了一种注射用凝胶,也许和外泌体关系不大,但是可以关注一下我PS中写的内容;第4篇是一个总结外泌体功能研究和实验相关技术的综述,它对目前外泌体研究相关技术的局限性的总结值得大家读一读;第6篇也是一个不错的文章,介绍了细胞外囊泡对肾脏缺血再灌注损伤的改善作用,研究外泌体功能的朋友可以关注和了解一下;第9篇是一个利用二代测序技术来寻找和监测细胞外囊泡在不同细胞间传递RNA的技术介绍。相关文章的原文在周一前会发布到论坛同名贴下,需要的可以到论坛下载。

1. Exploring the RNA landscape of endothelial exosomes. 探索内皮细胞来源外泌体的RNA构成。 [RNA] IF=4.61  PMID:29282313

摘要:外泌体是由大多数细胞类型产生的直径约100nm的小细胞外囊泡。这些囊泡携带核酸,蛋白质,脂质和其他生物分子,并作为细胞外通讯过程中生物信息的载体。外泌体的含量受母体细胞外部和内部微环境的调控,但分子载入外泌体的内在机制尚未完全阐明。在这项研究中,通过使用二代测序技术,我们深入地表征了健康内皮细胞和外泌体的RNA组成,并分别准确提供了两者中发现的不同编码和非编码RNA种类的概况。我们还发现了一组优先包含(或排除)在囊泡中的独特基因。此外,在研究了RNA基序在细胞和外泌体之间不均匀分布的基因中的富集之后,我们已经检测到一组用于几类RNA的富集序列。总之,我们的研究结果为研究能够识别RNA序列的RNA结合蛋白的参与及其在将RNA输出到外泌体中的作用提供了基础。

PS:一篇研究内皮细胞来源外泌体RNA构成的文章。重点不在于他们使用二代测序技术解析了健康内皮细胞和其外泌体的RNA组成,关键点在于他们基于测序结果分析并发现了一组可能的用于RNA运输进入外泌体的识别序列,这个研究结果值得我们了解和参考。

2.  Genetically Engineered Liposome-like Nanovesicles as Active Targeted Transport Platform. 基因工程设计的脂质体样纳米囊泡作为活性靶向药物运输平台。 [Adv Mater] IF=19.79  PMID:29280210

摘要:药物分子向各种类型的肿瘤细胞的配体靶向递送仍然是精准医学中的主要挑战。受天然外泌体的分泌过程和天然货物递送功能的启发,利用仿生合成策略制备可人工展示多种靶向蛋白/肽配体并直接包封用于增强药物生物功能的人工脂质体样纳米囊泡(BLN)用于靶向递送是一个可行的策略。这里,作为概念的证明,我们揭示了使用抗人表皮生长因子(hEGF)或抗HER2亲和体作为靶向分子的基因工程BLN被分别开发为靶向两种类型的肿瘤细胞的药物运输平台。值得注意的是,相比与hEGF共价偶联的合成脂质体,在这项工作中证明了在BLN上生物合成展示的hEGF配体具有较高的生物活性和靶向能力。此外,在HER2过度表达的BT474肿瘤异种移植模型中,显示在抗肿瘤效果方面具有亲和配体的加载阿霉素的BLN治疗效果要比临床批准的脂质体阿霉素(Doxil)好得多。这些数据表明BLN适合作为常规蛋白脂质体或免疫脂质体的有效替代物,其具有优异的靶向能力和易于生产特点。

PS:这是一个仿照细胞外囊泡进行开发设计的药物载体。研究囊泡作为药物载体的朋友可以读一读。

3.  Stem cell-inspired secretome-rich injectable hydrogel to repair injured cardiac tissue. 富含干细胞分泌组成分的可注射水凝胶用于修复受伤的心脏组织。 [Acta Biomater] IF=6.32  PMID:29281806

摘要:这项研究的目的是开发一种注射用且和生物相容性好的水凝胶,可以将由人类脂肪干细胞(hASCs)分泌的治疗性生物分子(分泌组)释放到梗塞周围的心肌中。将明胶和Laponite一起配制成剪切稀化的纳米复合水凝胶(nSi Gel)作为分泌物(nSi Gel +)的可注射载体。通过评估人脐带内皮细胞的增殖,迁移和管形成来在体外测试分泌组的生长因子组成和促血管生成活性。然后通过心肌内注射到梗塞周围区域,在体内研究nSi Gel +系统的治疗效果。随后评价炎症反应,血管生成,瘢痕形成和心脏功能。通过定量PCR和免疫组织化学测试证实了所开发的nSi凝胶的生物相容性,与未处理的对照组相比,炎性相关基因、微小RNA和细胞标志物表达水平没有显着差异。另外,只有用nSi Gel +处理组显示毛细血管密度显着增加,瘢痕面积减少和心脏功能改善。我们的体外和体内研究结果表明这种新的分泌蛋白装载的水凝胶作为治疗心肌梗塞的替代策略的潜力。基于干细胞的疗法代表了通过促进心脏保护,血管生成和减少的纤维化来修复受损心肌组织的可能解决方案。然而,最近的证据表明,大多数阳性结果可能是由于从细胞释放旁分泌因子(细胞因子,生长因子和外泌体),而不是因为干细胞的局部植入。必要的生长因子和旁分泌信号的这种混合物可以在体外分离,并且生物分子组可以通过改变干细胞培养条件来控制。在这里,我们提出了一个简单的策略,通过使用由明胶和Laponite制成的纳米复合可注射水凝胶来递送由hASC产生的分泌蛋白组。设计的分泌蛋白装载的水凝胶代表了传统的干细胞疗法治疗急性心肌梗塞的有希望的替代方案。

PS:这是一篇与外泌体联系不是很紧密的技术型文章,文章开发了一种可用于注射的水凝胶,实验验证了该凝胶递送干细胞来源分泌物来改善心梗预后的作用。虽然与外泌体关系不大,但是我们设想一下,如果用它包裹外泌体呢?就设想到这里,嘿嘿,点到为止。它可能是未来一个不错的缓释载体,感兴趣的赶紧看看吧。

4.  Biological Functions and Current Advances in Isolation and Detection Strategies for Exosome Nanovesicles. 外泌体样纳米囊泡分离检测及生物学功能研究进展。 [Small] IF=8.64  PMID:29282861

摘要:外泌体是源于细胞膜内吞过程的纳米级(≈30-150nm)细胞外囊泡,大多数类型的细胞均会释放外泌体到体液中循环。外泌体携带蛋白质,脂质,RNA和DNA等特定组成成分,并且可以作为货物载体将生物分子所携带的信息转移到受体细胞。最近对外泌体的研究表明,它们在细胞间信号传导,凝血,炎症和细胞稳态等多种生物学过程中起着重要的作用。这些功能性作用归因于它们转移RNA,蛋白质,酶和脂质的能力,从而影响包括癌症和神经变性,传染性和自身免疫性疾病(例如,癌症的发生,发展和转移)在内的各种疾病的生理和病理状况。由于这些独特的特性,外泌体被认为是有很有前景的生物标志物载体,有望用于通过无创或微创手术诊断和预后各种疾病。在过去的十年中,研究者已经开发了大量的基于光学和非光学的方法工具用于分析疾病特异性外泌体。在这里,我们讨论了外泌体作为生物标志物和治疗剂的主要生物功能,意义和潜在作用。此外,介绍了最常用的exosome分析技术,突出了现有技术的主要技术挑战和局限性。

PS:这是一篇挺值得一读的综述。该文章不但总结了目前外泌体研究领域在其生物学功能和应用方面的研究进展,同时还对目前外泌体研究的相关技术进行了汇总和讨论,讨论了这些技术目前的局限性。

5.  Exosomal proteins as potential markers of tumor diagnosis. 外泌体蛋白作为肿瘤诊断的潜在标志物。 [J Hematol Oncol] IF=6.35  PMID:29282096

摘要:液体活组织检查尤其是外泌体携带的肿瘤特异性分子的液体活检,能够“实时”的在肿瘤发展和进展过程中提供有用的信息。外泌体是膜包裹的囊泡,由多种细胞(包括癌细胞)大量持续释放,并广泛存在于体液中。肿瘤外泌体可以通过与靶细胞相互通讯来重塑肿瘤支持性的微环境。最近的研究主要集中在外泌体miRNA和蛋白质的一小部分。然而,检测基因组"输出结果"(即活性蛋白如磷蛋白)可以提供关于疾病进展的更直接的信息,可以完善癌症的早期发现和监测。这篇综述突出了相对于传统血清学标志物而言外泌体蛋白质的独特性,总结了它们在癌症诊断和预后中的最新用途。此外,我们描述了外泌体蛋白质组学的研究的一般方法,并强调了其临床应用价值。

PS:液体活检是这些年叫的最响亮的诊断研究风口,做诊断的人不说点液体活检方面的见解都不好意思说自己是做诊断的,泡沫不可避免,但是没有泡沫哪里来的投资人嘛,一定的泡沫才能让液体活检这个领域更快更好的发展下去。相信很多朋友关注外泌体其实更倾向于使用期作为液体活检的标志物载体,这里一篇综述,总结了外泌体蛋白作为液体活检标志物的研究进展,希望大家能够喜欢。

6.  Renal Tubular Cell-Derived Extracellular Vesicles Accelerate the Recovery of Established Renal Ischemia Reperfusion Injury.肾小管上皮细胞来源的囊泡加速肾缺血再灌注损伤的恢复。 [J Am Soc Nephrol] IF=8.97  PMID:28747315

摘要:缺血性肾损伤是一个复杂的综合征;多种细胞异常导致炎症循环加速、细胞损伤和局部局部缺血。没有单一的疗法能够有效地解决缺血后的肾损伤。然而,输注正常的成年大鼠肾细胞已经成功地治疗几种大鼠肾衰竭模型。由相对较少的供体细胞实现的持续的广泛的肾获益导致了这样的假设:源自这些细胞的细胞外囊泡(EV,主要是外泌体)是主要的治疗原因。我们的研究发现在大鼠肾缺血后24小时和48小时静脉给予成年大鼠肾小管细胞的EV可显着改善肾功能。此外,EV治疗显着改善肾小管损伤,4-羟基壬烯加合物形成,嗜中性粒细胞浸润,纤维化和微血管减少。 EV疗法还显着降低了缺血后观察到的大的肾转录组改变。这些数据显示EV在发生肾缺血性损伤后改善其预后的潜在效用。

PS:又一篇介绍细胞外囊泡功能的文章,值得了解一下。其实目前细胞外囊泡的研究依旧处于起步阶段,能够很好的阐释细胞外囊泡的一种功能也可以发表一篇不错的文章,机制什么的留给后人去发现吧~

7.  Calcium phosphate particles stimulate interleukin-1β release from human vascular smooth muscle cells: A role for spleen tyrosine kinase and exosome release. 磷酸钙颗粒刺激人血管平滑肌细胞释放白细胞介素-1β:脾酪氨酸激酶和外泌体释放的作用。 [J Mol Cell Cardiol] IF=5.68  PMID:29274344

摘要:研究人员在包括动脉粥样硬化和骨关节炎的几种炎性疾病中均发现磷酸钙(CaP)颗粒沉积物。CaP和其他形式的晶体和颗粒可以促进巨噬细胞中的炎性小体的形成,导致半胱天冬酶-1激活和成熟白细胞介素-1β(IL-1β)的分泌。鉴于小动脉粥样硬化纤维帽中小CaP颗粒与血管平滑肌细胞(VSMC)的密切关联,我们的研究旨在确定CaP颗粒是否影响人VSMC中的促炎信号传导。我们实验证明了CaP颗粒刺激增殖和衰老的人VSMC释放IL-1β,但从衰老细胞释放IL-1β明显更多;这需要细胞的半胱氨酸蛋白酶-1高活性而不是LPS的引发。同时证明了潜在的炎症小体激动剂包括ATP,nigericin和尿酸单钠结晶并没有刺激VSMCs释放IL-1β。 Western印迹分析表明CaP颗粒诱导脾脏酪氨酸激酶(SYK)的快速活化(增加的磷酸化-Y525 / 526)。 SYK抑制剂R406降低CaP颗粒处理的VSMC中的IL-1β释放和半胱天冬酶-1活化,这一研究结果表明SYK活化发生在caspase-1激活的上游并且是caspase-1激活所必需的。另外,IL-1β和caspase-1在细胞内体内囊泡中共定位,我们在从VSMC培养基中分离的外泌体中检测到IL-1β。此外,CaP颗粒处理以SYK依赖性方式刺激VSMCs外泌体分泌,而外泌体释放抑制剂能够减少IL-1β释放。CaP颗粒刺激VSMC中的SYK和半胱天冬酶-1活化,导致IL-1β的释放,其部分通过外泌体释放。这些在人类VSMC中的新发现突出了微钙化的促炎和促钙化潜能。

PS:文章介绍了微钙化在对VSMCs来源IL-1β和外泌体释放的影响,但是并没有深入探究其如何促进了外泌体的释放。大家适当了解一下。

8.  Biomarker Based Therapy in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma: An Emerging Reality? 基于生物标志物的胰腺导管腺癌治疗:一个新兴的现实? [Clin Cancer Res] IF=9.62   PMID:29269376

PS:你关注胰导管腺癌嘛?癌症之王! 关注的话那就读一读这篇文章吧,介绍了目前胰导管腺癌基于生物标志物指导临床治疗和用药的相关研究进展,涉及到传统标志物以及新型的液体活检标志物。

9.  A next generation sequencing based approach to identify extracellular vesicle mediated mRNA transfers between cells. 基于二代测序的方法来识别细胞之间的细胞外囊泡介导的mRNA转移。 [BMC Genomics] IF=3.73  PMID:29273013

PS:一篇识别和鉴定细胞外囊泡介导细胞间RNA转移的研究性论文,文章使用了二代测序来识别和鉴定这一过程,具体的实验方法和分析思路值得参考和学习一下。

 

今天的整理就到这里。希望大家可以有所收获。大家下周见!

 

 

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