三阴性乳腺癌（TNBC）是一种高度异质性肿瘤，缺乏有效的治疗方法，预后较差。外泌体可以包含许多细胞成分，包括核酸、脂质、蛋白质等，可以提供丰富的组学信息。同时，外泌体在肿瘤发生、转移和耐药性中发挥重要作用。然而，外泌体相关基因与三阴性乳腺癌异质性和肿瘤免疫微环境的关系还需要进一步探索。近日，上海交通大学医学院附属瑞金医院乳腺疾病诊治中心沈坤炜教授团队联合上海市第六人民医院，上海交通大学生物医学工程学院研究人员报道了基于三阴性乳腺癌患者外泌体的相关基因集，利用机器学习算法筛选的构建了9基因风险评分模型，并筛选了最具价值的核心基因。该研究可能有助于三阴性乳腺癌患者制定个性化治疗决策并改善其预后。相关成果以“An exosome-based specific transcriptomic signature for profiling regulation patterns and modifying tumor immune microenvironment infiltration in triple-negative breast cancer”为题发表于Frontiers in Immunology （2023 Dec 6:14:1295558）。文章的第一作者为上海交通大学附属瑞金医院乳腺疾病诊治中心王涵博士，王若博士研究生，通讯作者为上海交通大学附属瑞金医院乳腺疾病诊治中心的黄仁宏博士与王铮博士。 
该研究首先针对ExoCarta数据库中的外泌体相关基因，分析了外泌体基因在肿瘤组织和正常组织中的表达情况。随后，基于LOOCV机器学习方法拟合了87种预测模型用于评分系统的构建，并筛选了最高的C指数结果，最终确定了9个外泌体相关基因。随后基于9个外泌体相关基因构建风险评分模型，将三阴性乳腺癌患者分为高危组与低危组，高危组与低危组显示出了OS的显著差异。
随后，该研究基于低危组与高危组的不同预后，先后分析了两组生物过程及通路的激活状态差异，免疫浸润差异，突变差异，药物敏感性差异。最后，该研究基于随机森林算法，筛选了与三阴性乳腺癌患者预后最相关的外泌体相关基因：CLDN7，并进行了相关的实验验证。结果显示，CLDN7高表达外泌体促进了三阴性乳腺癌细胞的迁移与侵袭性；同时，109位三阴性乳腺癌患者的组织微阵列结果显示，CLDN7 高表达的 TNBC 患者 RFS 较差。总之，该研究基于外泌体相关基因集构建了TNBC的风险评分模型，将患者分为高风险组和低风险组。检测患者的外泌体相关基因可能成为未来预测 TNBC 预后的方法。CLDN7 可以作为 TNBC 人群的预后生物标志物。该研究有助于更好地理解外泌体相关基因与TNBC预后的关系，为TNBC的临床诊断和治疗提供新思路。
An exosome-based specific transcriptomic signature for profiling regulation patterns and modifying tumor immune microenvironment infiltration in triple-negative breast cancer, Front Immunol. 2023 Dec 6:14:1295558. doi: 10.3389/fimmu.2023.1295558.外泌体资讯网 Front. Immunol|上海交通大学医学院附属瑞金医院乳腺疾病诊治中心沈坤炜：外泌体相关基因集构建三阴性乳腺癌风险评分模型
